本片根据松本零士的经典科幻漫画改编。或许过去，又或许未来，人类大规模向宇宙殖民。当人口膨胀到五千亿的时候，散落在宇宙各个角落的人类返回故土地球，却引发了伤亡惨重的归乡战争。为了保护地球这片圣地，人类制定了盖亚制裁，约定不许任何人染指这里。可是曾经作为联合舰队舰长的哈洛克却背叛盖亚制裁，驾驶着他的阿尔卡迪亚号高举叛旗，成为逃逸一百年之久的通缉犯。联合舰队长官伊索拉指使自己的弟弟亚马混入阿尔卡迪亚号，探寻尼伯龙根人发明的永动机的秘密。在此期间，哈洛克率领船员向地球挺近，而联合舰..“这个是什么玩意？”楚阳一挥手，一大块金属落在了桌子上，咔嚓一声，素以坚硬稳固著称的黑檀桌子瞬时被压除了裂纹了，不过总算没有整个解体，只是整张桌子都在往下降，向着地面之下缓缓坠落。